بنا بر روایات تاریخی عمارت مسجد دو مناره سقز به زمان شیخ حسن مولان آباد از عرفای حکیم و ریاضیدان مشهور عصر افشاریه بر می گردد. هنگام عزیمت نادر شاه افشار به بغداد وی از منطقه ی سقز عبور کرد و طبق درخواست شیخ حسن مولان آباد برای ساخت مسجدی برای اهالی شهر سقز نادر شاه دستور ساخت این مسجد را در بافت قدیم شهر سقز داد. در حال حاضر نیز برخی از اهالی منطقه به این مسجد، مسجد شیخ حسن مولان آباد می گویند. از نشانه ها و دلایل صحت این مدعا این است که در این سفر نادر شاه دو عصای مرصع و یک سفره ی منقوش زیبای چرمی را نیز به شیخ حسن هدیه می دهد این وسایل در حال حاضر در قریه ی مولان آباد که آرامگاه این عرف عالی مرتبه در آن قرار دارد نگهداری می شود. همچنین یک جلد کلام ا… مجید خطی در مقبره ی شیخ حسن نگه داری می شود که هدیه ی یکی از روحانیون زمان شیخ حسن است و تاریخ آن به اواخر دوره ی افشاریه دلالت دارد. روستای مولان آباد در شصت و پنج کیلومتری شهر سقز به دلیل وجود این قرآن نفیس خطی که به خط زیبای شیخ مولانا از عرفای نامی منطقه نوشته شده، از اهمیت و جایگاه ویژه ای برخوردار است. پیشینه این قرآن را به دوران نادر شاه افشار نسبت می‌دهند و اهالی روستا معتقدند این قرآن در دوران صدر اسلام توسط شیخ حسن حسنی از شیوخ و بزرگان همین روستا نگارش شده است. گفته می شود، شیخ حسن، کاتبی به اسم یحیی داشت و او قرآن را با خط خود به رشته تحریر درآورده است. قرآن دارای حاشیه نویسی های متعددی ست که به دلیل استفاده از کاغذ ویژه ای برای نگارش تا کنون دستخوش هیچ تغییر و یا خدشه ای نشده. نقل است که شیخ حسن مولان آباد در ریاضیات مهارت و تبحر ویژه ای داشته و بطور چشم گیر و شاخصی در میان علما منطقه دارای نشان و جایگاه ویژه ای بوده است. مسجد تاریخی روستا چندین بار در طول تاریخ تعمیر و مرمت می شود. اما به مرور بخش هایی از آن تخریب می گردد، و به ناچار اصل بنا یک بار دیگر مجددا ساخته می شود و در آن اتاقکی نیز برای حراست از قرآن احداث می گردد. ساختمان جدید مسجد به فاصله اندکی از مقبره شیخ حسن که مشرف به تمام نقاط روستا ست احداث گردیده. و همانند سبک معماری رایج در مناطق کردنشین ایران چهار ستونی ، به همراه دو مناره بر پشت بام آن و با ویژگی های بومی منطقه طراحی، و توسط استادکاران محلی بنا شده است.